盡管哺乳動物胰腺的功能取決于不同細(xì)胞類型的復(fù)雜相互作用，但基因表達(dá)譜主要用大量混合物描述。從研究人員在這里以色列理工學(xué)院實(shí)施了基于液滴的單細(xì)胞RNA-seq方法，以確定來自四個人供體和兩個小鼠品系的超過12,000個個體胰腺細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組。
細(xì)胞可分為15個簇，這些簇與先前表征的細(xì)胞類型相匹配：所有內(nèi)分泌細(xì)胞類型，包括稀有ε細(xì)胞; 外分泌細(xì)胞類型; 血管細(xì)胞; 施萬細(xì)胞; 靜止和活化的星狀細(xì)胞; 和四種類型的免疫細(xì)胞。
研究人員檢測了具有不同表達(dá)譜的導(dǎo)管細(xì)胞亞群，并用免疫組織化學(xué)染色法驗(yàn)證了它們的存在。此外，在人類β細(xì)胞中，他們檢測到與功能成熟和ER應(yīng)激水平相關(guān)的基因調(diào)控的異質(zhì)性。
最后，他們使用單細(xì)胞數(shù)據(jù)對大量基因表達(dá)樣本進(jìn)行去卷積，以檢測與疾病相關(guān)的差異表達(dá)。該數(shù)據(jù)集為發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子，信號傳導(dǎo)受體和醫(yī)學(xué)相關(guān)基因提供了資源。
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