2016年，10x Genomics公司推出ChromiumTM系統(tǒng)，這是一套分子條形碼和分析系統(tǒng)，由儀器、試劑盒和信息學(xué)軟件組成，能全面對接Illumina測序儀。
盡管哺乳動物胰腺的功能取決于不同細胞類型的復(fù)雜相互作用，但基因表達譜主要用大量混合物描述。從研究人員在這里以色列理工學(xué)院實施了基于液滴的單細胞RNA-seq測序方法，以確定來自四個人供體和兩個小鼠品系的超過12,000個個體胰腺細胞的轉(zhuǎn)錄組。
細胞可分為15個簇，這些簇與先前表征的細胞類型相匹配：所有內(nèi)分泌細胞類型，包括稀有ε細胞; 外分泌細胞類型; 血管細胞; 施萬細胞; 靜止和活化的星狀細胞; 和四種類型的免疫細胞。研究人員檢測了具有不同表達譜的導(dǎo)管細胞亞群，并用免疫組織化學(xué)染色法驗證了它們的存在。此外，在人類β細胞中，他們檢測到與功能成熟和ER應(yīng)激水平相關(guān)的基因調(diào)控的異質(zhì)性。最后，他們使用單細胞數(shù)據(jù)對大量基因表達樣本進行去卷積，以檢測與疾病相關(guān)的差異表達。該數(shù)據(jù)集為發(fā)現(xiàn)新的細胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子，信號傳導(dǎo)受體和醫(yī)學(xué)相關(guān)基因提供了資源。
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